魏晋隋唐时期吴姓迁移
魏晋至隋唐的七百余年间，北方少数民族不断入侵中原，致使北方战争频繁，南方则相对安定。因而北方士民大量南迁，吴氏宗族也在南迁之列。据唐林宝撰写的《元和姓纂》记载，这期间的吴氏大族主要分布在吴郡、武昌、濮阳、渤海、陈留等地，并呈南兴北衰之势。
自吴允承回迁吴郡奉祀先祖吴太伯三代之后，历史进入了三国时期，吴氏家族成为割据江东的孙吴政治的国戚，孙策、孙权兄弟的母亲吴国太便出自吴郡吴氏。
据《江阴吴氏统宗源流考》记载，吴允承之子奉祀侯吴妁早逝，留下两子两女。长子吴熊庆继承父业，留居吴郡。次子吴景和两个姐姐南下钱塘（今浙江省杭州）投奔亲戚。吴氏姐弟少年寄人篱下，历经生活艰辛之苦。吴氏两姐妹由于出自名门之后，如花似玉，德才兼备，远近闻名。
吴郡富春（今浙江省富阳县）人孙坚当时才20岁，在当地做官，很有势力。他慕名前去求婚，吴家亲戚嫌孙坚粗鲁、狡诈，不答应这门亲事。孙坚遭到拒绝后既羞惭又气恼，他扬言要报复。吴景的大姐姐怕连累亲戚就劝说：“不要因为我一人而拖累大家，如果那人不好，就怪我命运不好吧。”这样吴家大女儿就嫁给了孙坚，史称吴皇后，后来她的妹妹做了孙坚之妾。谁料孙坚日后竟发达起来，后官至破虏将军，领豫州牧，成了东汉末年的一大军事割据势力。吴夫人先后为孙坚生了四子，孙策、孙权、孙翊、孙匡，妹妹为其生了孙郎、孙仁两兄妹。孙权则继承父兄打下的基业，成了一代帝王，建立了东吴政权，与魏、蜀鼎分天下。公元202年吴夫人去世，与丈夫孙坚合葬于高陵（今江苏省丹阳县境内），后尊为武烈皇后。
吴景，少时与两个姐姐相依为命，因而深得孙策、孙权兄弟的敬重，他官至丹阳太：守，封扬武将军，为孙吴政权屡建战功。吴景去世后，其长子吴奋继续被孙权重用，封为吴郡都督，统兵镇守东方，后封为新亭侯。吴奋死后，其子吴安袭爵，吴安之时，孙权三子孙和被立为太子，四子孙霸封为鲁王，他与太子争宠。吴安和东吴一些大臣依附鲁王孙霸，图谋杀害太子。事情败露后，吴安随鲁王孙霸一同被孙权赐死，吴景长子一支至此绝传。吴景次子吴祺被孙权封为都亭侯，死后，子吴纂袭封，吴纂娶东汉都亭侯滕胤之女为妻。孙权死时遗命滕胤、诸葛恪辅佐幼主，吴纂岳父成了东吴顾命大臣。后来孙坚之弟孙静的曾孙孙峻、孙琳兄弟弄权，杀害了滕胤、诸葛恪，诬陷其谋反。吴纂一家受株连而遇害。至此吴郡吴氏只剩下吴妁长子吴熊庆这一支了。
吴熊庆自幼聪明过人，被时人誉为神童。吴妁死后，吴熊庆即以长子身份留居吴郡，顶立吴氏门户。孙权称帝后，尊封大舅吴熊庆为太傅、吴郡公。这支吴氏在东吴四代被封侯，以国戚、先贤后裔风光于世，直到公元280年东吴灭亡，吴熊庆四世孙嗣贤侯吴之则遇害，这支吴氏才退隐于民间。半个世纪后，东晋王朝建立，江浙一带又成为统治中心。公元323年，晋明帝追封古先贤后裔，吴之则之孙吴皋益被封为昭衍公，这支吴氏又重新肇显于世。尤其是吴皋益长子吴佶因娶晋明帝穆皇后之妹庾氏为妻，与皇帝结为亲戚而官运亨通。吴佶在东晋出任高官中书令，后又被封为渤国公。吴佶共生七子，后世人丁兴旺，数代得以封侯拜爵。东晋末年，其四世嫡孙镇北将军吴豫，在与北魏的战争中阵亡，其孀妻刘氏携幼子吴戢迁徙到暨阳（今江苏省江阴县）。吴戢一支在暨阳定居六代，历宋齐两朝，其间有子孙出仕为官，名见于正史记载。到吴戢六世孙吴樛时，又迁居武昌郡的汉阳山。吴樛是吴季扎第四十一代孙，南齐时人。他迁居汉阳山后，隐居不仕，以耕读传家，其子孙兴旺数百年而不绝，成为当地望族，世称武昌吴氏。后来，武昌郡也成为晚唐吴姓的七大郡望之一。
吴樛生有二子，其中以长子吴盾一支较为兴旺。吴盾在南朝梁武帝时，官任大司马、侍中等要职，陈霸先起兵灭梁时战死。吴盾死后，得到朝廷追封，被诏葬于今湖北江陵，并建祠祭祀。吴盾家室因而从武昌汉阳山迁居江陵，吴盾这一支吴氏历南朝后期战乱，至隋唐两代，其裔孙都曾入仕为官。其中吴盾曾孙吴若远，字伯高，唐太宗时考中进士，历任中书舍人、户部侍郎、银青光禄大夫之职。吴若远对吴氏最大的贡献，是在其先祖吴胜修撰的家谱基础上，编撰了完整的吴氏正宗族谱。至此，吴氏正宗的迁徙流变的历史才清晰可鉴，有史可考。据吴氏家谱记载，吴若远之子吴世伟娶唐太宗李世民之女平乐公主为妻，官拜驸马都尉，封新封侯。吴世伟生有二子，长子吴佐、次子吴兢。次子吴兢迁居汴州仪，后来成了唐代著名的史学家。吴佐之子吴可博唐玄宗天宅年间中进士，后官至尚书右仆射，成为唐朝显赫一时的政要，赐封为渤海郡公。吴可博死后，其长子吴舜咨凭借父荫当上了山阴令。其家室迁往山阴（今浙江省绍兴），后代子孙繁衍成山阴吴氏。
山阴吴氏以诗书传家，出了不少文人雅士。其中就有吴舜洛长子吴翥，他生性淡泊，看轻仕途，定居山阴，潜心著书立说。著有《山阴集》、《闲情集》、《招云集》传世，从以上书名可看出吴翥寄情于山间、白云的高雅志趣。唐武宗年间，当地政府多次请他出山做官，均被其拒绝。地方官后来把他的事迹上报朝廷，连唐武宗都很钦佩其清高气节，赐号他为“文简先生”。吴翥作为山间文士被当朝皇帝赐名成为一时美谈。吴翥长子吴融也是文人，称得上唐后期著名的文学家。《旧唐书》记载，吴融自幼勤奋读书，后中进士，做了韦昭度的书记官（即幕僚之类的官）。他的文章洒脱而华丽，因而常常恃才傲物。一次韦昭度讥笑他写的文章不好，吴融公然反驳：“此自是吴家文字，非老夫攻之乃意。”此后，吴融文章以“吴家文字”为号成为文坛美谈。吴融先后历任著作郎、侍御史、户部侍郎、翰林之职，后裔兴旺。据《山阴州山吴氏族谱》记载，吴融生有主子，繁衍成为山阴吴氏的三大分支，这三支吴氏后来又分迁各地。其中，吴融次子吴元睿迁回祖籍江陵，此距其先祖吴盾（季扎 42代孙）诏葬江陵大约有三百余年历史。三子吴少颠一支迁回诸暨（今浙江省诸暨县）。吴融长子吴元三，字若虚，官至翰林院修撰，他娶唐宗室之女为妻，生有三子。其长子吴彬，字文郁，封骠骑将军，家居陕西咸阳，后又迁回吴郡虞山。至此，季扎次子吴征生后裔经一千余年辗转流徙，到公元 10世纪，由季扎53代孙吴彬回迁到其直系先祖吴季扎始封之地——古延陵。
吴元三次子吴彪一支也迁回江苏无锡——古吴国旧地，主持吴姓始祖吴太伯庙祀，成为无锡吴氏主宗。无锡吴氏后来又分衍出六合、高邮、晋陵、邗里、新塘等众多的吴姓分支。
隋唐，吴姓在我国南北方都得到巨大的发展，并逐渐在许多地方形成当地一大郡望。其中南阳吴氏，为汉初长沙王后裔吴复兴所开基，其后子孙繁衍各地，形成许多吴氏望族分支。但就其繁衍的势力和分布的密集程度而言，在魏晋以后，吴氏北上繁衍明显的缓和了许多，基本上是以我国南方一带为其繁衍的地区，这是与北方连年战乱，民不聊生有着密切的关系。据史料记载，吴氏子孙在江南分支开基的地方主要有今浙江的杭州、杭井、奉化、温州、临海、平阳、临安；江西的兴国、石杭；福建的莆田、福州、漳州、泉州、汀州；广东的潮州、嘉应州、南雄；广西的梧州、南思等地。其开基大都在秦汉以后，其中浙江、江西等地在隋唐之前；福建、广东等地在唐以后。
另据史料记载，入闽始祖祭公字孝先，为泰伯六十二世孙，原居河南光州固始，唐时随王审知入闽平黄巢起义，堂族六人分居福州、泉州之间，称吴氏六祖，支分漳州及泉州。入粤始祖吉甫公，为宣公与世孙，宣公原居四川后迁江西南丰，后因战乱迁至福建汀州宁化县 总之，吴氏虽遍及全国，但繁衍发展中心为江南一带。
据《海盐吴氏宗谱》(光绪22年版)记载，廷尉吴公晚年定居石门语溪洲钱（今浙江省桐乡县西石门），故居至清末尚存。谱称语溪洲钱吴氏，家族非常兴荣。大约在宋代中期，吴氏子孙，恃贵犯法，给语溪洲钱吴氏带来厄运。谱称因为这次犯事，至使语溪吴氏家族“家被籍，丁口窜毙殆尽”，仅有一胤，侥幸逃过于这场劫难。
大难后幸存的一胤生了三个儿子，后来分居三处：长子吴德昭，留居石门洲钱祖居；次子吴德彰，赘居德清（今浙江省德清县）勾垒；三子吴德辉，赘居海宁县治前。留居语溪氏，后又分出三派：一派为吴绳翁后裔，分居马头村；一派分居海盐；一派分居石硅村，为吴申孙的后裔。
海盐吴氏一派，以吴馨为一世始祖。据《海盐吴氏宗谱》记载：海盐吴氏一世祖吴馨，字世芳，明末处士，世代居住在石门语溪洲钱。吴馨生子吴贤济，字北皋，排行第四。吴贤济是石门县的 岁贡生，即秀才，当明朝末年，为避兵灾战乱，他将家室迁居海盐冈图画桥，成为海盐吴氏的始迁祖。
吴贤济迁居海盐画桥后，娶妻李氏，生育两子：长子吴相，次子吴宰。这两个儿子，以后又分为海盐吴氏的两个支派：吴相一支为海盐吴氏东支，吴宰一支为西支。海盐吴氏东西两支，后裔人丁兴旺，以书香传家。
陈留吴氏，属季札一支的后裔。传到吴恢这一代，家族始兴。吴恢官任南海郡（今广东省广州市)太守，是二千石的大官。吴佑是吴恢的小儿子，自幼随父亲学习儒家经典，稍大便颇有主见卓识。12岁时，吴佑随父亲到广州。当时，吴恢准备制作大批竹简用来写经书，吴佑劝阻说：“此书写成，势必动用车辆搬运回中原。别人不知内情，还会以为你在广州搜刮了大批珍奇异物。大凡易引起嫌疑的事，君子都极为慎重。”吴恢听后，感慨地说：“吴姓宗族，真是世代不乏优秀的‘季子’呀！”
父亲去世后，吴佑回到长垣县牧养读书，自得其乐。后举孝廉，又以品性敦厚、质朴、逊让、节俭，升任胶东侯相（胶东侯国在今山东省平度县）。任职 9年，为政宽仁，深得人心。
后又改任齐侯国相（今山东省淄博市），因刚直不阿，得罪大将军梁冀，被降为河间侯相（河间侯国在今河北河间、献县一带）。不久，辞官回乡，以教授经书为业，成为当时著名学者。活到98岁时，寿终正寝，葬在长垣。
吴佑生了两子：长子吴凤，少子吴恺。吴凤，字君雅，官任汉乐浪郡（今朝鲜民主主义人民共和国平壤市）太守。这是见于史书记载的最早到达今朝鲜国的吴姓成员。吴凤生的一个儿子吴冯，字子高，官任鲷阳侯国（今安徽省临泉县鲷城）相。吴凤的弟弟吴恺，任新息（今河南省息县）令。
陈留吴氏吴恢祖孙4代为官，知名于当时。吴佑后代繁衍发达，因而陈留一地，成为魏晋至隋唐时期吴姓的一大郡望。