宋靖康之难是汉人南迁的第三次高潮(三)
元朝末年，元政府连年对外用兵，对内实行民族压迫，加之黄河、淮河流域水灾不断，饥荒频仍，终于激起连绵十余年的红巾军起义。元政府予以了残暴的镇压，争域夺地的殊死之战时有发生，两淮、山东、河北、河南百姓十亡七八。元末战乱的创伤未来得及医治，明初“靖难之役”又接踵而至。鲁、冀、豫、皖、苏等省深受其害，出现了大片无人区、无人村。
唐宋以来山西洪洞成为晋南人口最稠密的大县。在元末战乱时，蒙古地主武装察罕贴木儿父子统治的山西，却是另外一种景象，相对显得安定，风调雨顺，连年丰收，较之于相邻诸省，经济较繁荣，人丁兴旺。
明洪武二年（1369）至永乐十五年（1417），明太祖朱元璋和明成祖朱棣均采纳了大臣建议，鉴于元末十几年的农民战争，造成中原一带人烟稀少、田地荒芜的局面，为了恢复和发展生产，巩固边防，推行移民垦荒，振兴农业的政策，并从地狭人稠地区向边陲和人口稀少地区移民，以巩固封建王朝的统治。50余年间组织了8次大规模的移民活动。在洪洞县城北2里处的古道边广济寺设移民局，集中迁转，编排队伍，发放“凭照川资”。于是，广济寺院西有株大槐树，为会集之所，成千上万户人家，从大槐树下迁出，移民启程时，纷纷指槐为记，依依惜别，频频回首。最后只有大槐树和汾河滩上的老鹳窝依稀可辨，故，大槐树和老鹳窝也就成为惜别的家乡标志。
明初从山西洪洞等地迁出的移民主要分布在河南、河北、山东、北京、安徽、江苏、湖北等地，少部分迁往陕西、甘肃、宁夏地区。从山西迁往上述各地的移民，后又转迁到云南、四川、贵州、新疆及东北诸省。如此长时间大范围有组织的大规模迁徙，在我国历史上是罕见的，而将一方之民散移各地，仅此一例而已。
现洪洞古槐树公园祭祖小屋里贴着一张“古槐后裔姓氏表”，该表上共有450姓，供奉着他们的牌位，其中就有马氏。如在山东莱州和登州（今烟台地区），移民多为山西洪洞人和河北枣强人。当地盛传洪武年间或明初从云南移民于此，实为永乐年间大批卫所军人从云南调来，其后裔居留至今。据明、清陕西郃阳志书资料记载，郃阳县在宋代以前的主要姓氏中就有马姓。元朝末年，由于战乱和灾疫使关中成为了“春燕归来无栖处，赤地千里少人烟”的地域，姓氏大减。《明史》中记载：“晋王曾多次带山西军出塞外筑城屯田，迁往陕甘地区者达二十余县”。 现郃阳县民间谍谱、墓碑和祠堂碑文都有明洪武、永乐年间自山西平阳府洪洞县大槐树处迁民至郃阳的记载，百良乡的马姓，就是明代两次大规模移民中自大槐树下移入的。还有如河南禹州马文升支马氏、河南安阳马丕瑶支马氏等，其祖上都是明洪武年间从洪洞大槐树下迁徙今地的。
在明代，马氏又出了一位贤后，为明朝开国皇帝朱元璋的元配夫人马秀英，自此马姓族人遍布福建；综观历史，汉、唐、明三朝是马氏人口发展的三个高峰，在政治、军事、经济等方面的名人也就特别多。
元朝出现蒙古人的马姓，如马祖常一支的马姓；元末至明初，回族人士纷纷改取汉式姓氏，多依经名的译音来取汉姓，多以马为首选之姓，分布于祖国大江南北，成为我国当代回族的第一大姓。如元代回族中杰出的政治家赛典赤?赡思丁?乌马尔有五子，各有政绩，他们的后裔取父祖辈的名字为姓，以永远铭记先人的丰功伟业，由此形成“十三姓”，其中就有马姓。外族与汉族长期混居后，一部分成为今天的回族和当地的少数民族的马姓，但有一部分逐渐同化为南北各地的马姓汉族之中，这种情况在整个汉族马姓中所占比例极小。南方东南沿海地区马姓中融入外族基因主要始于明、清时期，来源仍以海上做贸易的中东伊斯兰教回回人。回民迁徙还有一个特点就是“大分散，小集中”，这样也大大增强了回民中马姓人的迁徙力度。
马姓人口在明朝时期（1368—1644），大约有78万人，约占全国人口的0.84%，排在第22位。宋、元、明近600年里全国人口纯增长率是20%，马姓人口增长比全国人口的增长要高，这600年中马姓人口纯增长率高达26%，人口纯增了16万。明朝时期，山东仍然为马姓第一大省，约占全国马姓总人口的15.6%，占山东省总人口的1.6%。在全国的分布主要集中于山东、浙江（12%）、河北（10.8%）、江苏（9.8%），这四省大约占马姓总人口48.2%；其次分布于陕西（8.4%）、山西（8.1%）、河南（7.3%），这三省的马姓又集中了23.8%。在《元朝100大姓的分布频率》中，马姓排在第19位。在《明朝100大姓分布频率》中，马姓排在第22位。宋、元、明期间，马姓的分布总格局变化较大，其人口主要由北方向东南和西北迁移。全国仍以黄河流域地区为主要的马姓聚集地区，但在东南地区的江浙重新形成另一大块马姓人口聚集中心。
清康熙年间，有的马氏从广东、福建等沿海一带迁到港澳台，有的又远徙东南亚及欧美的一些国家。这时期有辽宁朝鲜人的马姓、满洲八旗费莫氏和马佳氏等氏族改马姓。几千年的中华民族历史发展进程中，历朝历代各民族之间大融合以及相互通婚，少数民族中马姓的加入，更加壮大了马姓人的队伍，也给马姓增加了新的血液，大大增加了马姓人口。