明朝时期，石姓大约31万人，约占全国人口的0.33%，排在第六十九位。山东为石姓第一大省，约占石姓总人口的22%。在全国的分布主要集中于山东、浙江、陕西、广西，这四省大约占石姓总人口的54%。其次分布于湖北、河北、湖南等省。宋元明600余年，由于战乱，石姓在北方遭到重大的创伤，人口急剧减少。石姓的分布总格局发生了变化，其人口向四方迁移。石姓的河南中心消失，调整为四块石姓的聚集地。
